军队那边则由中央统一实施管理，以军机处、军务处，军勤处这三个直接向嬴子戈负责的部门为主统领。，
军机处，直接向嬴子戈负责，其中都是军师谋主，分析天下形势，部署调动军队进攻、防御、驻守等都由他们来负责建议嬴子戈。军务处，掌管军法，部队划分，将领，士卒军功的考核，职位的任免、升降、以及调动。军勤处，负责后勤，粮草兵戈，战马甲猬，以及将领士卒的饷银发放。
军政虽然分离，但是却统一行使爵位制相等的十四品制，以正一品为最高，从七品为最低。至于再低的正品到从九品，则属于不入流的官位，虽然为官，但是却无爵，只能算是小吏。
至于最后的部门细化，实际上就是细化到个人，将整个大秦帝国的所有事务，无论军政，统统都详细的分到部门，甚至是部门中的小部门，乃至具体的官位或者是人的身上，责任追究亦是一视同仁。
总之，随着百里奚、蒙毅等人一个接一个的看完了商鞅所书的这份名为奏章，实际上却是强国富民，一统天下的通天大策以后，每个人的脸色都变的兴奋起来，既是对商鞅大才的服气，也是对未来大秦的憧憬。
“妙哉，妙哉，哈哈”众人尚且还沉醉以及思索、接受、吸收商鞅所书的种种新法中，并且考虑其会对大秦，对天下带来的影响，还有会对他们个人带来的影响的时候，一袭白衣的郭嘉已经悄悄的侧身从一旁看完了这份商鞅奏章，当即一拍手掌，满良喜意的对着嬴子戈恭喜道：“嘉恭喜主公得此治国平天下之良策，商君不愧为古今法家第一人，嘉佩服！”
“郭大人谬赞了，鞅不过是得蒙主公以及诸位大人的遗惠，如无主公的智谋指引，如无诸位大人的盛秦五子法铺垫，鞅纵然有通天之能，也不过就是作出那二十级军功爵罢了！”商鞅眸子微微闪过，虽然心中同样自豪，但是毕竟是死过一次，活出第二世的老狐狸，商鞅虽然变法之心不变，但是性格上特别是在面对君上和同僚的相处之道上，比之上一世，却是要成熟圆滑了许多。，
嬴子戈神色淡然的望着商鞅和郭嘉的交流，并不多做表态，同为绝顶文臣，虽然擅长的方面不同，可是嬴子戈相信他们知道怎么相处。现在最重要的实际上还是商鞅的这个新法，虽然嬴子戈在复生商鞅重用的同时，将商鞅放到了自己特意修建的藏书阁三层中许久，无论是盛秦五子法还是自己记忆中那些未来的奇思妙想，绝顶智慧，他都随意混乱的放入了其中，毕竟有很多知识，嬴子戈自身也是知其然而不知其所以然，之所以写下来，放入其中，为的也不过是想要引起一些进入之人的智慧灵光，在智慧之火的碰撞下，产生更好的东西出来。
毕竟很多时候，如商鞅、郭嘉、百里奚这些人，缺的并不是智慧，而只是那一丝丝灵光和眼界见识，果不其然，商鞅这一次就给了嬴子戈极其的惊喜，千年智慧的火光和当世智者的碰撞，算是产生了一份让嬴子戈兴奋的成果。
说来也奇怪，无论是穿越融合时被各种能量改造过的嬴子戈，还是郭嘉、百里奚、贾诩、蒙毅、法正都可谓是当世智者，他们一起弄出来的盛秦五子法可以说已经达到了嬴子戈意料之外的惊喜效果，但是在商鞅这个同级别的智者面前，他们的心血却只是成了一个让商鞅开阔眼界，产生灵感的物件。却也是让嬴子戈不得不在心中暗暗的感叹一句，术业有专攻，纵然同样是为顶级智者，可是相比于专攻法家，变法强国之道的商鞅。无论是胸中藏甲百万的鬼才郭奉孝，还是霸秦的百里子明，或者是上大夫蒙毅、未来谋主法正，千古毒士贾诩，还是缺了那么一些东西，而这些东西却格外重要。
想到这里，嬴子戈不由好奇地深深看了商鞅一眼，心中暗暗庆幸，自己当初并没有因为商鞅前世的最终遭遇而放弃复生，而是冒着失去一个绝世大才的机会，悍然将其复生，并且一点一滴的进行了引导，方才有今日的惊喜。
心中虽然惊喜，但自从担任了秦王这个职位，成为了大秦复兴的希望之主的嬴子戈，早就已经习惯了威严和喜怒不形于色的状态，虽然惊喜，表面却是不露声色，微微一笑道：“商君之能，之心，孤早就明了于心。此次商君为我大秦立下此不世之功，孤王更是会铭记于心。在此孤向你承诺，此次新法推行变动，依然全权由你负责，无论涉及到哪一方面，涉及到谁，其人都必须全心配合，如若不然，定斩不饶！”
说罢，嬴子戈思量了一下，站起身来，缓缓自腰间抽出了自己佩戴的玄铁短刀，沉默了一下放到了商鞅的手中，脸色平静的说道：“此刀自孤临世以来，就一直陪在孤的身边，今孤先将其赐予商君，为商君推行新法开路，如有违逆者，自大将主官以下，商君自可斩之，如有大将主官阻拦，商君也可以此刀将其带来孤之面前，孤自会为你讨一个说法！”
嬴子戈轻描淡写的说出这些话时，众人的神色皆是微微一变，除了郭嘉依然洒脱的小酌着自己手中酒葫芦中的美酒以外，无论是百里奚还是蒙毅的瞳孔都微微的向内缩了一下，就是一直脸色淡然无比的商鞅本人，在神色激动了之后，也是小心翼翼地抬眸去探视了一下嬴子戈的神色，思量着迟疑了一下，方才咬了咬牙，躬身恭敬的接了下来。
“谢君上恩典，鞅必然不负主公厚望！”接下这把刀的瞬间，商鞅心中微微的咯噔了一下，因为他知道，自己从现在开始是真的再也没有了退缩后悔的权利，唯有一心一意的为嬴子戈，为大秦做好这份要事。至于最后的结局，嬴子戈毕竟不是孝公和惠王，当今之大秦也毕竟不是先秦！
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